במקרים נדירים, ניתן לשלול פיצויי פיטורין מעובד שסרח בדרך כזו או אחרת אך בסופו של דבר קשה מאד לקבל היתר לכך על ידי בית הדין לעבודה שכן במקרים רבים ידם של מעסיקים רבים קלה על ההדק והם נוטים לעשות דין לעצמם, דבר שידוע לבית הדין לעבודה שידון בשל כך בכל מקרה לגופו.
המקרים המובהקים בהם ניתן לשלול פיצויי פיטורין הינם במקרים של, עבירות פליליות כנגד המעסיק או בחצריו, גניבה מצד העובד, רשלנות שהוכחה, הסכם קיבוצי השולל את הפיצויים, נזק שגרם עובד למעסיק, ועוד.
עובד שפיצויי הפיטורין שלו נשללו באופן שרירותי על ידי המעסיק, אין בכך סוף פסוק ומומלץ לו לפנות לייעוץ משפטי מקצועי בכדי לבחון את האפשרות להתמודד מול המעסיק ולהשיב את הפיצויים.
לצד שלילת הפיצויים, נוהגים מעסיקים לשלול מעובדיהם גם רכיבי שכר ואף את השכר עצמו כאשר לדעתם העובד עשה מעשה המצדיק זאת, דבר שעשוי להוות הלנת שכר בלתי מוצדקת.
חשוב לדעת כי חוק הגנת השכר מתיר ניכוי כספים בשל חוב אך לא בהכרח בשל מעשה כזה או אחר.